Для уникнення хвороб сою краще вирощувати після колосових культур і картоплі

Насичення сівозмін соєю призводить до накопичення інфекції в ґрунті. 

Щоб цього запобігти,  слід протягом двох років уникати висіву сої на поля після багаторічних бобових трав. Найкращими попередниками для сої є озимі та ярі колосові культури, картопля. 

У процесі вегетації сої обов’язковою умовою є проведення фітосанітарного моніторингу посівів. Це дасть можливість своєчасно виявити й локалізувати вогнище хвороби або припинити подальший розвиток. 

На особливу увагу посіви сої потребують під час тривалих періодів теплої та вологої погоди, сприятливої для поширення збудників септоріозу, аскохітозу, пероноспорозу, церкоспорозу, фузаріозу та ін. 

На цьому етапі на перше місце виходить хімічний метод захисту рослин, бо на сьогодні тільки застосування фунгіцидів забезпечує швидкість і надійність захисного ефекту проти низки хвороб.