Виявити АЧС за 20 хвилин під силу новітньому CRISPR-тесту

Китайські науковці з Сільськогосподарського університету Шаньсі та Медичного університету столиці розробили інноваційну діагностичну платформу на основі CRISPR, яка дозволяє виявити вірус африканської чуми свиней (АЧС) лише за 20 хвилин.

Простота використання й висока точність методу роблять його потужним інструментом для раннього виявлення захворювання та швидкого реагування на спалахи, пише PigUA.

Новий тест отримав назву sCRAM (suboptimal PAM-mediated CRISPR-Cas12a Rapid ASFV Method). Він поєднує кілька технологій у єдиній пробірці, зокрема багатоферментну ізотермічну ампліфікацію (MIRA) та CRISPR-Cas12a-систему, оптимізовану для роботи за температури 37°C протягом 15 хвилин. Перед цим відбувається етап швидкого вивільнення нуклеїнових кислот за 40°C протягом 5 хвилин.

Завдяки такій комбінації процес не потребує складного підготовчого етапу чи екстракції ДНК ‒ достатньо мінімальної кількості зразку.

Результати тесту можна зчитувати візуально під ультрафіолетовим світлом або за допомогою тест-смужок. У дослідженнях на 111 лабораторних і клінічних зразках крові, плазми й мазків нова система продемонструвала:

• 100% збіг результатів із методом qPCR за УФ-зчитування;
• 98,2% збіг за використання тест-смужок;
• 100% специфічність і відсутність перехресних реакцій із іншими поширеними збудниками хвороб свиней.

За словами авторів розробки, sCRAM має великий потенціал для використання безпосередньо на фермах або у регіонах із обмеженими лабораторними ресурсами. Це може стати важливим проривом у системі моніторингу АЧС.

Раніше ми писали про метод виявлення вірусу АЧС у ротовій рідині свиней.

Довідка

Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) ‒ технологія для редагування геномів тварин у боротьбі зі спадковими хворобами, покращення їхнього здоров’я та створення стійких до хвороб особин.