Метагеномне секвенування здатне одночасно визначити повний профіль мікробіоти

Метагеноміка змінює парадигму діагностування хвороб у птиці. Традиційні методи (ПЛР, бактеріологія) працюють за принципом «є підозра ‒ шукаємо конкретного збудника». Однак за змішаних інфекцій цього недостатньо. Метагеномне секвенування дає змогу одночасно визначити повний профіль мікробіоти.

Про це пише журнал «Наше птахівництво».

Метод виявляє інфекцію в організмі птиці на стадії колонізації, дозволяє оцінити баланс мікробіому та вчасно помітити дисбіоз ‒ зміну співвідношення на користь агресивних видів.

Аналізується взаємодія мікроорганізмів: хто є первинним тригером патології, а хто ‒ вторинною мікрофлорою. Це дає розуміння механізму запуску хвороби й дозволяє адаптувати стратегію профілактики до конкретного майданчика.

Як повідомлялося, клебсієльоз зазвичай проявляється як частина змішаних інфекцій.